Universitas Pendidikan Ganesha (UNDIKSHA) resmi berdiri pada tahun 2006. Namun, sejarah perjaanan kampus ini sudah dimulai sejak tahun 1950-an dengan misi utama, yaitu untuk memenuhi kebutuhan guru di Indonesia.

Dulunya, Universitas Pendidikan Ganesha merupakan bagian dari Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas Airlangga Surbaya. Kemudian, diintegrasi ke Universitas Udayana menjadi FKIP Universitas Udayana. Pada tahun 1993, FKIP Universitas Udayana mengalami perubahan status menjadi Sekolah Tinggi Keguruan dan Ilmu Pendidikan (STKIP) Singaraja, berdasarkan Surat Keputusan Presiden Republik Indonesia No. 8 Tahun 1993. Ketika itu, STKIP Singaraja mengelola 4 fakultas, antara lain Fakultas Ilmu Pendidikan, Fakultas Pendidikan Bahasa dan Seni, Fakultas Pendidikan Ilmu Pengetahuan Sosial, dan Fakultas Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam.

Pada perkembangan selanjutnya, berdasarkan Keputusan Presiden Nomor 19 Tahun 2001 tanggal 5 Februari 2001, STKIP Singaraja disetujui berubah bentuk menjadi Institut Keguruan dan llmu Pendidikan (IKIP) Negeri Singaraja. Pada fase ini, IKIP Negeri Singaraja membuka banyak program studi baru, mulai dari jenjang D3 hingga program Pascasarjana.

Berkat kerja keras dan keinginginan yang kuat dari seluruh civitas akademika IKIP Negeri Singaraja untuk terus meningkatkan kualitas dan melakukan pengembangan kampus yang lebih luas, akhirnya pada tahun 2006, IKIP Negeri Singaraja resmi menjadi Universitas Pendidikan Ganesha (UNDIKSHA), berdasarkan Perpres No. 11/2006 tanggal 11 Mei 2006. Saat ini, UNDIKSHA telah mengelola 6 fakultas dan 3 program studi Pascasarjana.